En 1894 se inició una colección dentro del Museo de Ciencias Naturales, formada por objetos históricos que con el tiempo dieron origen a una nueva institución.
En 1927, el entonces gobernador Benjamín Solano González firmó el decreto de creación del "Museo Colonial Histórico y de Bellas Artes".
Ese año se eligió una antigua casona en la calle 9 de Julio como sede. El arquitecto Martín Noel diseñó y donó un nuevo frente de estilo colonial plateresco.
El 26 de abril de 1929 fue inaugurado oficialmente. Sus muestras fueron conformadas a partir de arte sacro, documentos, cuadros y otros objetos donados por familias correntinas o recuperados de colecciones oficiales.
En la década de 1940, se incorporó el legado del coleccionista Félix Bunge. Esto enriqueció la sección de Bellas Artes.
Más adelante, en 1965, esas obras fueron trasladadas al nuevo Museo de Bellas Artes y el edificio original, por calle 9 de Julio, quedó dedicado por completo a la historia.
